В общем случае, при получении предоплаты надо рассчитать НДС и заплатить его в бюджет. Но при длительном производственном цикле (6 месяцев и более) НДС с авансов не начисляют.
Если компания получила предоплату в счет предстоящих поставок товаров (выполнения работ / оказания услуг), длительность производственного цикла изготовления которых составляет свыше 6 месяцев (по перечню, определяемому Правительством) – она имеет право определять момент налоговой базы по НДС как день отгрузки.
Однако, необходимо вести раздельный учет операций и сумм налога по приобретаемым товарам (работам / услугам), используемым для производства длительного цикла и других операций.
Еще одно условие – при получении аванса, в таком случае, одновременно с декларацией по НДС надо предоставлять контракт с покупателем и документ, подтверждающий длительность производственного цикла. Такое разъяснение дает Минфин в письме от 25.11.2024 № 03-07-11/117712.
Если эти условия не соблюдаются – придется заплатить НДС с аванса. Если потом условия стали соблюдаться, то НДС с новых авансов уже можно не платить, но по старым авансам убирать НДС и сдавать уточненки не надо.
Таким образом – если компания ранее платила НДС с авансов, не пользуясь своим правом их не платить, то тот НДС пересчитать уже нельзя. Но потом она может начать пользоваться этим правом и не платить НДС с новой предоплаты (при соблюдении вышеуказанных условий).